Detail publikace

Computational Tools for Designing Smart Libraries

ŠEBESTOVÁ Eva, BENDL Jaroslav, BREZOVSKÝ Jan a DAMBORSKÝ Jiří. Computational Tools for Designing Smart Libraries. Directed Evolution Library Creation. Methods in Molecular Biology. New York: Springer US, 2014, s. 291-314. ISBN 978-1-4939-1053-3. Dostupné z: http://link.springer.com/bookseries/7651
Název česky
Výpočetní nástroje pro návrh "smart libraries"
Typ
kapitola v knize
Jazyk
angličtina
Autoři
Šebestová Eva, Mgr., Ph.D. (LL)
Bendl Jaroslav, Ing. (UIFS FIT VUT)
Brezovský Jan, Mgr., Ph.D. (LL)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (LL)
URL
Klíčová slova

řízená evoluce, racionální design, zlepšení enzymatických vlastností, chytré knihovny

Abstrakt

Tradiční experimenty využívající řízenou evoluce jsou často časově, laboratorně i finančně náročné, protože zahrnují opakované cykly náhodné mutageneze a selekci nebo screening velkých knihoven mutantů. Efektivita experimentů řízené evoluce může být značně zlepšena cílenou mutagenezí na limitovaný počet hot-spot pozic a / nebo výběrem limitované sady substitucí. Návrh takových smart knihoven ("chytrých" knihoven) může být významně zjednodušen in silico analýzou a predikcemi. V této kapitole předkládáme přehled tradičních nástrojů aplikovatelných pro (a) identifikaci hot-spotů pro inženýrování enzymatických vlastností a (b) výběr z predikovaných hot-spot pozic a konkrétních aminokyselin k záměně. Vybrané nástroje nevyžadují žádnou specifickou znalost a mohou být snadno použity širokou vědeckou komunitou

Rok
2014
Strany
291-314
Kniha
Directed Evolution Library Creation
Řada
Methods in Molecular Biology
ISBN
978-1-4939-1053-3
Vydavatel
Springer US
Místo
New York, US
DOI
10.1007/978-1-4939-1053-3_20
BibTeX 
@INBOOK{FITPUB10601,
   author = "Eva \v{S}ebestov\'{a} and Jaroslav Bendl and Jan Brezovsk\'{y} and Ji\v{r}\'{i} Damborsk\'{y}",
   title = "Computational Tools for Designing Smart Libraries",
   pages = "291--314",
   booktitle = "Directed Evolution Library Creation",
   series = "Methods in Molecular Biology",
   year = 2014,
   location = "New York, US",
   publisher = "Springer US",
   edition = "2nd ed.",
   ISBN = "978-1-4939-1053-3",
   doi = "10.1007/978-1-4939-1053-3\_20",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/10601"
}
Nahoru