Ing. Ivana Burgetová, Ph.D.

RUDOLFOVÁ Ivana a ZENDULKA Jaroslav. Clustering of Protein Sequences. In: Proceedings of 1st International Workshop WFM'06. Přerov: MARQ, 2006, s. 71-78. ISBN 80-86840-20-4.
Jazyk publikace:angličtina
Název publikace:Clustering of Protein Sequences
Název (cs):Shlukování proteinových sekvencí
Strany:71-78
Sborník:Proceedings of 1st International Workshop WFM'06
Konference:1st International Workshop on Formal Models (WFM'06)
Místo vydání:Přerov, CZ
Rok:2006
ISBN:80-86840-20-4
Vydavatel:MARQ
Klíčová slova
proteinové sekvence, optimální yarovnání dvou proteinových sekvencí, konečné automaty, shlukování, podobnostní funkce
Anotace
Jednou z metod, jejiž výsledky mohou být využity pro predikci struktury proteinů, je shlukování proteinových sekvencí. Shlukovací metody rozdělují objekty do tříd na základě podobnosti. Podobnost dvou proteinových sekvencí může být určena na základě skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí. Tento článek je zaměřen na využití formálních modelů pro popis problému shlukování proteinových sekvencí. Je zde popsán Needleman-Wunsch algoritmus pro nalezení skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí a konečný automat, který umožní výpočet tohoto skóre.
BibTeX:
@INPROCEEDINGS{
   author = {Ivana Rudolfov{\'{a}} and Jaroslav Zendulka},
   title = {Clustering of Protein Sequences},
   pages = {71--78},
   booktitle = {Proceedings of 1st International Workshop WFM'06},
   year = 2006,
   location = {P{\v{r}}erov, CZ},
   ISBN = {80-86840-20-4},
   language = {english},
   url = {http://www.fit.vutbr.cz/research/view_pub.php.cs?id=8058}
}

Vaše IPv4 adresa: 18.232.53.231
Přepnout na https