Detail publikace

Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization

DVOŘÁK Pavel, KURUMBANG Nagendra, BENDL Jaroslav, BREZOVSKÝ Jan, PROKOP Zbyněk a DAMBORSKÝ Jiří. Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization. ChemBioChem, roč. 15, č. 13, 2014, s. 1891-1895. ISSN 1439-4227. Dostupné z: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cbic.201402265/full
Název česky
Maximalizace efektivity multi-enzymového procesu pomocí optimalizace stechiometrie
Typ
článek v časopise
Jazyk
angličtina
Autoři
Dvořák Pavel, Mgr. (LL)
Kurumbang Nagendra, Ph.D. (LL)
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D. (FIT VUT)
Brezovský Jan, Mgr., Ph.D. (LL)
Prokop Zbyněk, doc. RnDr., Ph.D. (LL)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (LL)
URL
Klíčová slova

biokatalýza, biotransformace, kinetické modelování

Abstrakt

Multi-enzymové procesy reprezentují důležitou oblast biokatalýzy. Jejich efektivita může být zlepšena optimalizací biokatalytické stechiometrie. V tomto článku prezentujeme worfklow pro maximalizaci efektivity tří-enzymového systému katalyzujícího pěti-krokovou chemickou konverzi. Kinetické modely dráhy popisují buď wild-type nebo inženýrované enzymy byly vytvořeny a stechiometrie enzymů každé dráhy byla optimalizována. Matematické modelování a laboratorní experimenty poskytly detalní vhled do dynamiky dráhy, což umožnilo výběr vhodného inženýrovaného (vylepšeného) enzymu a zlepšilo efektivitu, zatímco snížilo množství potřebného biologického materiálu. Optimalizace stechiometrie v dráze inženýrovaného enzymu snížilo celkové množství potřebného biologického materiálu o úctyhodných 56%. Naše workflow představuje široce aplikovatelnou strategii pro optimalizaci multi-enzymových procesů.

Rok
2014
Strany
1891-1895
Časopis
ChemBioChem, roč. 15, č. 13, ISSN 1439-4227
Vydavatel
WILEY
DOI
UT WoS
000341586100007
BibTeX
@ARTICLE{FITPUB10595,
   author = "Pavel Dvo\v{r}\'{a}k and Nagendra Kurumbang and Jaroslav Bendl and Jan Brezovsk\'{y} and Zbyn\v{e}k Prokop and Ji\v{r}\'{i} Damborsk\'{y}",
   title = "Maximizing the Efficiency of Multi-enzyme Process by Stoichiometry Optimization",
   pages = "1891--1895",
   journal = "ChemBioChem",
   volume = 15,
   number = 13,
   year = 2014,
   ISSN = "1439-4227",
   doi = "10.1002/cbic.201402265",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/10595"
}
Nahoru