Detail publikace

Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments

RUDOLFOVÁ Ivana, ZENDULKA Jaroslav a LEXA Matej. Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments. In: Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010. Lecture Notes in Computer Science, roč. 6266. Heidelberg: Springer Verlag, 2010, s. 94-101. ISBN 978-3-642-15019-7.
Název česky
Shlukování proteinových substruktur pro nalezení nových sekvenčně-strukturních fragmentů
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
angličtina
Autoři
Abstrakt

V této publikaci představujeme novou metodu pro shlukování proteinových substruktur, kterou jsme vyvinuli za účelem studia vztahů meyi proteinovými sekvencemi a jejich strukturou. Jsou zde předloženy výsledky porovnání naší metody s metodou k-medoids. Publikace také obsahuje nástin metody pro hledání sekvenčně-strukturních fragmentů, které se běžně vyskytují v omezením počtu strukturních konformací. Tato metoda využívá prezentovanou sklukovací metodu.

Rok
2010
Strany
94-101
Sborník
Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010
Řada
Lecture Notes in Computer Science
Svazek
6266
Konference
International Conference on Information Technology in Bio- and Medical Informatics, Bilbao, ES
ISBN
978-3-642-15019-7
Vydavatel
Springer Verlag
Místo
Heidelberg, DE
DOI
EID Scopus
BibTeX
@INPROCEEDINGS{FITPUB9338,
   author = "Ivana Rudolfov\'{a} and Jaroslav Zendulka and Matej Lexa",
   title = "Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments",
   pages = "94--101",
   booktitle = "Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010",
   series = "Lecture Notes in Computer Science",
   volume = 6266,
   year = 2010,
   location = "Heidelberg, DE",
   publisher = "Springer Verlag",
   ISBN = "978-3-642-15019-7",
   doi = "10.1007/978-3-642-15020-3\_9",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/9338"
}
Nahoru